Trzecia część prowadzi bohaterów w ciemniejszą stronę historii. Powraca mrok, śnieg, poczucie straty i kolejna katastrofa, która narusza świat z trudem odbudowywany przez Laurę. Na powierzchnię wychodzą dawne traumy, wspomnienia z dzieciństwa i tajemnice ludzi, którzy do tej pory pozostawali w tle.
Laura i Stan ruszają do Portugalii śladem wskazówek pozostawionych przez João. Mają znaleźć klucz prowadzący do rozwiązania, ale sprawę komplikują tajemnicze trzęsienia ziemi w Europie, będące odbiciem wojny toczącej się po drugiej stronie. Pojawia się również Strażniczka Daru Myśli, która może zmienić zasady gry.
Po mrocznej stronie jest studium emocji ukrytych najgłębiej: tęsknoty, lęku, utraty, tajemnic i wspomnień, które potrafią wrócić w najmniej oczekiwanym momencie. Pyta o katharsis, oczyszczenie, nowy początek, siłę prawdziwej miłości i przyszłość młodego pokolenia obdarzonego Darami.